A260/280和A260/230分别为1.70和2.37
2结果与分析
2.1基因组DNA的肠道肠埃提取
利用NanoDrop2000对提取的CMCC44841基因组DNA进行了纯度测定,A260/280和A260/230分别为1.70和2.37。集聚菌菌利用qubit荧光计对提取的性大希氏EAECDNA测定了浓度为65ng/µL,提取的体和DNA能够满足后续全基因组测序和标准物质制备的实验要求。
2.2全基因组测序分析结果
本研究利用二代高通量全基因组测序技术对CMCC44841进行了序列测定。标准获得的物质基因组序列信息结果通过生物信息学分析,CMCC44841基因组大小为5.057285Mb,肠道肠埃其N50重叠大小为114319bp,集聚菌菌共121个长度从305600bp到505bp不等的性大希氏contigs,GC含量为50.6%,体和编码区基因5173个。标准利用CGE网站KmerFinder对细菌进行种属鉴定,物质结果显示CMCC44841鉴定为大肠埃希氏菌(Escherichiacoli),肠道肠埃具体鉴定结果如表2所示。集聚菌菌同时利用CGE网站进行血清预测、性大希氏多位点序列分型(MLST)和毒力基因分析,CMCC44841血清预测结果为O127:H21,MLST为ST40型,携带毒力基因除aggR、astA、pic之外,还预测到含有aap、aar、afaD、agg3C、lpfA、ompT等毒力基因,详见表3。CMCC44841全基因组测序数据已上传至NCBI数据库,序列号为SRR12278211。
2.3特征性基因PCR扩增结果
按照GB4789.6-2016的方法对CMCC44841分别进行了astA、aggR、pic特征性基因检测。PCR扩增结果显示提取的CMCC44841DNA分别扩增出102bp、400bp和1111bp长度片段。不同浓度DNA扩增结果如图1所示,0.1、0.01、0.001ng/µl的DNA均有特征性基因扩增产物,选择CMCC44841DNA冻干小球标准物质使用时PCR的模板量≥0.1ng/µl,按照20ng/球进行DNA标准物质的制备。
2.4标准物质的均匀性检验结果
随机抽取的20瓶EAEC菌体标准物质平板计数结果如表4所示。所有样品菌落数均在103CFU数量级,数值符合正态分布。SPSS软件单因子方差分析结果显示,F=1.59<F临界值=2.137,P>0.05。表明在显著水平为0.05时,本次所制备的EAEC菌体标准物质组内和组间无显著性差异,即样品符合均匀性要求。
随机抽取10瓶EAECgDNA标准物质,PCR产物电泳结果显示,10个gDNA标准物质的astA、aggR、pic基因均得到清晰的扩增条带(图2)。
相关链接:标准物质,提取,基因
声明:本文所用图片、文字来源《食品科学》,版权归原作者所有。如涉及作品内容、版权等问题,请与本网联系删除。
【A260/280和A260/230分别为1.70和2.37】相关文章:
- 1海疑旗下竟然借有如许的足机产品!支撑NFC服从,线上低至699元
- 2第十届法中电影节 乌尔善费翔等《封神》主创亮相
- 3《再会长江》曝预告 跨越6300公里展现十年巨变
- 4《小谢尔顿》结局曝片段 谢米搞笑互怼cp感满满
- 59000mAh超大年夜电池!金坐再出商务千元机,仅卖999元
- 6《来福大酒店》曝预告 黄轩柳岩组“临时家人”
- 7迷你剧《我的阿勒泰》:剧集里的诗意世界
- 8朱一龙《人生大事》片段 坚韧孤儿野蛮生长惹人爱
- 9“孤注一掷”爱情续集?电影《骗骗喜欢你》定档
- 10第77届戛纳电影节开幕在即 部署人工智能安保技术
- 11《猩球崛起:新世界》特辑 导演亮相推荐IMAX体验
- 12《沙漏》曝预告 邱天包上恩黄明昊传递救赎力量
- 13尖端好术办事商北京摩凌确认参展2024 ChinaJoy BTOB -
- 14日版《不能说的秘密》曝预告 主题曲命运感拉满
- 15《再会长江》曝预告 跨越6300公里展现十年巨变
- 16《发小儿万岁》曝终极预告 见证胡同发小儿友情
- 17重庆关于对光伏压延玻璃项目风险预警信息处理意见的公告,产业数据
- 18《帕丁顿熊3》曝光宣传海报 英伦小熊返乡回秘鲁
- 1摩托罗推那款千元机跌至999元!拆备120Hz下刷大年夜屏,借有5000万像素主摄
- 2《飞黄腾达》回应特朗普方控诉:起诉挺多胜率不高
- 3亚当温加德退出!《哥斯拉大战金刚3》将另寻导演
- 4《九龙城寨之围城》票房破5亿 确认将打造三部曲
- 5散文好段戴抄大年夜选散文大年夜齐典范豪情故事大年夜齐少篇
- 6两部《加勒比海盗》电影开发中!沙丘表舅或将主演
- 7IMAX曝《特技狂人》导演特辑 刺激嗨爽高能绝技
- 8《街头霸王》曝LOGO 喷绘涂鸦设计还原游戏质感
- 9交通运输部:多措并举提升适老化无障碍出行服务水平
- 10漫威将推出幻视新剧集 幻视启程探寻人生新目标
- 11大魔王法鲨《黑袋子》开拍 剧情保密悬疑感拉满
- 12迪士尼砍到“大动脉”!为削减成本皮克斯裁员14%
- 13少篇案牍战顺治愈简短的爱情小故事—惹人共叫的感情散文
- 14迪士尼砍到“大动脉”!为削减成本皮克斯裁员14%
- 15《母亲的直觉》曝预告 悬疑气氛拉满人性角力惊心
- 16上影节影展精粹单元首批片单曝光 领略电影新潮流
- 17联名大户Converse又出新联名 与广告业结合?
- 18《帕丁顿熊3》曝光宣传海报 英伦小熊返乡回秘鲁